Se llaman palabras homónimas, a aquellas cuya pronunciación es igual o similar pero difieren en su significado. Dentro de éstas, se distingue entre las palabras homófonas y las homógrafas. Las primeras, se pronuncian igual pero se escriben de un modo diferente y tienen significaos distintos, y las segundas, difieren también en su significado pero la grafía es indéntica.
En lo que sigue, se da una lista de palabras homónimas que suelen plantear dudas en la escritura.
a (preposición) - ah (interjección) ha (verbo haber)
abollado (hundido por golpe) - aboyado (finca con bueyes)
abrazarse (estrechar con los brazos) - abrasarse (quemarse)
acerbo (áspero, duro) - acervo (montón de cosas)
agito (verbo agitar) - ajito (ajo pequeño)
alagar (llenar de lagos) - halagar (mostrar afecto, admiración)
aprender (adquirir conocimientos) - aprehender (asir)
arrollo (verbo arrollar) - arroyo (río pequeño)
as (campeón deportivo) - has (verbo haber)
as (carta de la baraja) - haz (manojo, superficie)
Asia (continente) - hacia (preposición)
ato (verbo atar) - hato (sustantivo)
baca (elemento de transporte) - vaca (hembra del toro)
bacía (vasija) - vacía (verbo vaciar)
bacilo (bacteria) - vacilo (verbo vacilar)
balido (sonido de la oveja) - valido (primer ministro o verbo valer)
barón (título aristocrático) - varón (hombre)
basar (asentar sobre la base) - bazar (tienda, mercado)
basto (tosco, grosero) - vasto (ancho)
baya (fruto carnoso) - vaya (verbo ir)
bello (hermoso) - vello (pelo corto y suave)
bienes (posesiones) - vienes (verbo venir)
bobina (carrete) - bovina (perteneciente al toro o la vaca).
botar (arrojar, dar botes) - votar (emitir votos)
botas (calzado) - votas (verbo votar)
cabo (punta, grado militar) - cavo (verbo cavar)
callado (verbo callar) - cayado (báculo)
callo (dureza, verbo callar) - cayo (isla)
calló (verbo callar) - cayó (verbo caer)
cause (verbo causar) - cauce (de un río)
ceda (verbo ceder) - seda (tejido)
cede (verbo ceder) - sede (local, lugar)
cenado (verbo cenar) - senado (cámara de senadores)
cepa (tronco de la vid) - sepa (verbo saber)
ciego (invidente) - siego (verbo segar)
ciervo (nimal salvaje) - siervo (esclavo)
cierra (verbo cerrar) - sierra (instrumento de corte)
cien (número) - sien (frente)
cocer (cocinar) - coser (verbo coser)
combino (verbo combinar) - convino (verbo convenir, acordar)
desmallar (quitar mallas) - desmayar (desvanecer)
errar (sinónimo de equivocarse) - herrar (poner herradura a una caballería)
estibo (estibar) - estivo (verano)
gira (excursión, viaje) - jira (trozo de tela)
graba (verbo grabar) - grava (carga, tributo, piedrecillas)
grabar (Señalar con incisión o abrir y labrar en hueco o en relieve sobre una superficie un letrero, una figura o una representación de cualquier objeto ) - gravar (imponer un gravamen)
grabe (verbo grabar) - grave (de gravedad)
gragea (confite pequeño) - grajea (verbo grajear)
haber (verbo) - a ver (preposición a + verbo ver)
había (verbo haber) - avía (verbo aviar)
halla (verbo hallar) - haya (verbo haber o tipo de árbol) aya (sinónimo de niñera)
hasta (preposición) - asta (lanza, palo)
hojear (pasar las hojas) - ojear (escudriñar)
hora (unidad de tiempo) - ora (verbo orar)
hulla (tipo de carbón) - huya (verbo huir)
huso (instrumento para hilar) - uso (verbo usar)
ingerir (tomar alimentos) - injerir (incluir Lgo)
izo (verbo izar) - hizo (verbo hacer)
La Haya (ciudad) (la) - aya (institutriz) - la haya (pronombre la + haber): no creo que la haya visto.
libido (deseo carnal) - lívido (intensamente pálido y amoratado)
malla (red) - Maya (antiguo pueblo indio)
masa (volumen) - maza (arma de guerra)
nabal (tierra de nabos) - naval (de naves)
novel (el que comienza a practicar un arte o profesión o tiene poca experiencia en ellos) - Nobel (premio)
ola (onda marina) - ¡Hola! (interjección, saludo)
onda (ondulación) - honda (pronfunda)
olla (vasija redonda) - hoya (cavidad)
pollo (cría de ave) - poyo (banco de piedra)
pulla (dicho agudo para herir a alguien) - puya (punta acerada de varas de picadores)
sabia (que sabe) - savia (jugo de las plantas)
té (infusión) - te (pronombre personal)
rallar (desmenuzar con un rallador) - rayar (hacer rayas)
rayo (fenómeno atmosférico) - rallo (verbo rallar)
rebelar (sublevarse) - revelar (fotografías, descubrir)
recabar (reclamar, conseguir) - recavar (volver a cavar)
reusar (volver a usar) - rehusar (rechazar, no aceptar)
rivera (río) - ribera (orilla)
riza (verbo rizar) - risa (expresión de alegría)
sabia (que sabe mucho) - savia (líquido de las plantas)
tubo (sustantivo) - tuvo (verbo tener)
valla (línea de estacas o tablas) - vaya (verbo ir)
vegete (verbo vegetar) - vejete (diminutivo de viejo)
veraz (verdadero) - verás (verbo ver)
veta (vena, filón) - beta (letra griega)
vez (tiempo, turno) - ves (verbo ver)
vidente (lo que ve) - bidente (dos dientes)
U (lerta del alfabeto) - ¡Uh! (interjección)
zueco (calzado de madera) - sueco (de Suecia)
Cuadro obtenido de "http://www.wikilengua.org/index.php/Lista_de_palabras_hom%C3%B3nimas"